Пещера "Ящик Пандоры" была открыта в начале 1970-х годов сотрудниками  Сыйской гляциологической станции. На тот момент пещера представляла собой единственный входной световой грот "Широкий". С 1976 года попытки проникнуть в подземную систему через соседние мелкие пещеры вели спелеологи . В 1981 году целенаправленные раскопки в "Широком" спелеологами Осинников и Томска  вскрыли проход в верхние этажи пещеры.Всего было прокопано около 50-ти метров наклонных ходов, которые в доисторическое время были доступны людям, о чем говорит находка глиняного горшка в начале раскопок и человеческого скелета в устье наклонного колодца, ведущего в грот "Синдибобель"

       По-видимому,Каменный мешок и открыващиеся в его бортах пещеры и гроты в древние года неоднократно посещались людьми. До сих пор на каменной сыпухе на дне Каменного мешка находят осколки керамики, наконечники стрел , человеческие кости. Так, в октябре 1994 года на дне коньона , примерно напротив входа в пещеру "Мышинная", была найдена лучезапястная кость человека.

       Ящик Пандоры является наиболее крупной пещерой в районе села Малая Сыя. Согласно официальным данным ее глубина 182 метра, а длина ходов превышает 11 километров. Пещера находится в карстовом ущелье на левом берегу Белого Июса, примерно посередине между селами Малая Сыя и Ефремкино, в районе Чертова поворота. От дороги к пещере ведет хорошо заметная тропа.

      Вход в грот "Широкий" имеет ширину шесть метров при высоте около полутора. Сразу за входом высота и ширина грота увеличивается. Имеется несколько удобных площадок для палаток. Рядом с гротом можно легко найти достаточное количество дров, однако нет воды. Поэтому спелеологи , посещающие Ящик Пандоры, оборудуют лагерь в гроте "Широкий" лишь в зимнее время. Весь грот через вход просвечивается дневным светом. Здесь имеются старые разрушающиеся натеки. Раскопанное продолжение пещеры расположено у основания левой стены грота. В настоящее время прокопанная часть весьма расширена и представляет собой участок вертикальных и наклонных галерей, приводящих к колодцу в грот "Синдибобель". Почти всегда в этих ходах дует сильный ветер , из-за чего входная часть получила название "пылесос". Впрочем, благодаря ветру, вырвавшемуся на встречу "копателям" и само подземелье получило свое имя -  Ящик Пандоры.

     Колодец в грот "Синдибобель" начинается пологой катушкой. Крепление веревки за массивную  глыбу слева. Примерно через пять метров катушка еще более выполаживаетсяи, за почти горизонтальной полкой начинается крутой почти отвесный спуск. Колодец камнеопасен! Общая длина требующейся веревки 20-25 метров. Спуск осуществляется на спусковом устройстве, подъем лазанием с самостраховкой. В средней части колодца имеется подвешенное озерцо.

     В гроте " Синдибобель" обилие разрушенных тектоническими подвижками натеков. Дальнейший путь из этого грота начинается в его наиболее низкой левой части. Здесь вдоль левой коренной стены по тектоническому разлому можно подняться вверх в систему грота "Дельтаплан" (так называемый верхний этаж пещеры) или через узкие вертикальные лазы в глыбовом навале вдоль коренной стены спуститься вниз. Ход вниз тоже был прокопан и называется "кемпдевид". Вертикальный узкий лаз среди расклиненных каменных глыб  приводит в высокую галерею, открывающуюся на высоте около десяти метров в левой стене грота "Маркетова Бездна". Спуск и подъем с этого уступа возможен свободным лазанием. Внизу, после спуска лазанием, необходимо закрепить за глыбы двадцатиметровую веревкудя дальнейшего пути на дно грота.

     Справа по ходу из грота "Маркетова Бездна" крутая катушка  ведет в грот "Сатурн". Веревка длиной 15 метров крепится за проушину. Но чаще спелеологи проходят этот отвесик свободным лазанием. Со дна грота "Сатурн" ходы ведут в лабиринтные системы "Кольца Сатурна", самый же правый ход через низкие и достаточно узкие ходы в глыбовом навале приводит к  гроту "Камбала". В левой верхней части этого зала расположены проходы в основную часть пещеры. Спуск начинается по вертикальной щели шириной около сорока сантиметров - "Синей Гусенице". За "Синей Гусеницей" следует система небольших обвальных залов, главный из которых называется "Черепаха" Продолжение пещеры следует искать в левых ответвлениях.

      За наклонным ходом следует колодец "Белый Слон" глубиной 25 метров. Крепление веревки за шлямбурные крючья. Колодец сперва наклонный, а последние восемь метров отвесный.  Дно - "Стакан", имеет диаметр около пяти метров. Раньше из "Стакана" сложным лазанием поднимались к колодцу "Караллитовый", который ведет в грот "Богом забытый" В этот же грот ведет "Подростковый ход" - узкий лаз со дна "Стакана" с несколькими крутыми подъемами и спусками.

      Начиная с "Богом Забытого", следует горизонтальная часть пещеры с обилием озер. В этих озерах есть рыба, она белого цвета. Называют ее слепой, так как глаз у нее почти нет.

      Над озером, за которым  расположена главная часть нижнего этажа пещеры, натянуты стационарные перила. Первопроходцам здесь пришлось воспользоваться резиновой лодкой.

       Специфика прохождения,( как предупреждают проводники перед спуском) Ящика Пандоры состоит в том , что людям, попавшим в нее первый раз, трудно рассчитать силы - подъем в узостях среди глыбовых навалов намного сложнее и продолжительнее спуска. Поэтому неподготовленным посетителям подземелья лучше ограничиться осмотром натеков в гроте "Синдибобель" и экскурсией в верхние этажи пещеры.

         В пещере "Ящик Пандоры" с момента ее открытия до настоящего времени произошло три несчачтных случая с летальным исходом и все три с новосибирцами.  

         Первый несчастный случай произошел 3 декабря 1989 года с Андреем Агеевым (студент НГУ,21год) Он поднимался в трубу "Звездопад" над "Бешеным колодцем" с нижней страховкой с помощью 8-мм статической веревки. Веревка шла через крюк и два перегиба. Выйдя на 8 метров над крюком, он сорвался и веревка оборвалась, упал на дно "Бешеного колодца", пролетев более 50-ти метров.

         Второй несчастный случай произошел летом 2003 года, погиб Станислав Шубин ( 34 года, археолог из Новосибирска). Мужчина был в пещере впервые без опытного сопровождающего. Вместо инструктора с ним отправили 16-летнюю девочку. Поднимался по катушке из "Синдибобеля", страхуясь с помощью одной грудной обвязки. При прохождении 3-метрового уступа сорвался и обвязка сдавила ему грудь. Девочка, вместо того чтобы обрезать веревку, побежала за спасателями. Когда они прибыли, мужчина уже задохнулся.

         Третий случился 2 февраля 2005 года. Погиб Павел Галкин (23 года аспирант СибГУТИ) Дальняя стена грота находящаяся в гроте "Рашпиль" за восходящим ходом оказался живым завалом. Завал обрушился, засыпав двоих.  Одного через сутки откапали абаканские спасатели живого,(он попал в небольшую камеру образовавшуюся между завлом и стеной), тело П.Галкина смогли достать только через неделю, завал постоянно оседал.